Protein–RNA interactions for Protein: Q15404

RSU1, Ras suppressor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 277 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSU1Q15404 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 TAPBP-236ENST00000456592 817 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 AC005786.3-201ENST00000589360 565 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 PRKACA-209ENST00000590853 1101 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 FFAR4-203ENST00000604414 1142 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RSU1Q15404 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
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