Protein–RNA interactions for Protein: Q15399

TLR1, Toll-like receptor 1, humanhuman

Predictions only

Length 786 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TLR1Q15399 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
TLR1Q15399 MRC2-201ENST00000303375 5988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 TYMSOS-201ENST00000323813 844 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 TNFRSF19-202ENST00000382258 1625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 ACADVL-205ENST00000543245 2227 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 PARD3-206ENST00000374776 3389 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 LCN10-205ENST00000497771 723 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
TLR1Q15399 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms