Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC243965.2-201ENST00000612576 2671 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC29.17■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 FBXL15-202ENST00000369956 2344 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 KANK3-203ENST00000593649 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 COPE-202ENST00000349893 948 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 SLC9A3-AS1-204ENST00000606288 791 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
GAPVD1Q14C86 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 C14orf79-202ENST00000547315 2370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 CHRNA5-203ENST00000559554 1051 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
GAPVD1Q14C86 AF228730.6-201ENST00000641497 218 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
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