Protein–RNA interactions for Protein: Q14680

MELK, Maternal embryonic leucine zipper kinase, humanhuman

Predictions only

Length 651 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MELKQ14680 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MELKQ14680 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MELKQ14680 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MELKQ14680 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
MELKQ14680 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MELKQ14680 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MELKQ14680 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
MELKQ14680 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
MELKQ14680 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 ICAM4-201ENST00000340992 1176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
MELKQ14680 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MELKQ14680 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MELKQ14680 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MELKQ14680 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
MELKQ14680 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MELKQ14680 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
MELKQ14680 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MELKQ14680 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MELKQ14680 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MELKQ14680 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MELKQ14680 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
MELKQ14680 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms