Protein–RNA interactions for Protein: Q13635

PTCH1, Protein patched homolog 1, humanhuman

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Length 1,447 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTCH1Q13635 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 NETO1-207ENST00000583169 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC24.7■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
PTCH1Q13635 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 MFSD1-219ENST00000622669 2361 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AC106028.4-201ENST00000614509 607 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 ST3GAL4-217ENST00000534083 1919 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 CBLN2-201ENST00000269503 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 LINC02558-202ENST00000436395 298 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
PTCH1Q13635 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
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