Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Length 336 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PRDM5-201ENST00000264808 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 NF2-208ENST00000403435 2568 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
XRCC4Q13426 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
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