Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ERLIN1-203ENST00000421367 5792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 C2orf82-202ENST00000409230 663 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 TEX264-209ENST00000457573 1448 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GRIK2Q13002 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GRIK2Q13002 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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