Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.46
BNIP3Q12983 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 MIR5100-201ENST00000579544 119 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 MAN1A1-201ENST00000368468 5014 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 AL512343.2-201ENST00000609423 490 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
BNIP3Q12983 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
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