Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 LLGL2-203ENST00000392550 3509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 CDHR5-201ENST00000349570 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
NFIAQ12857 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC21.08■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CIDEB-202ENST00000336557 2409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC016999.1-201ENST00000447880 452 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CHMP1A-208ENST00000550102 803 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
NFIAQ12857 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
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