Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDG4

SCRN3, Secernin-3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCRN3Q0VDG4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 P2RX5-TAX1BP3-201ENST00000550383 5905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 FAM50B-201ENST00000380272 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 MBD1-208ENST00000398493 1845 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 ZNF48-205ENST00000613509 3339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 AC012306.2-201ENST00000609350 630 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 TTLL12-201ENST00000216129 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
SCRN3Q0VDG4 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.4 ms