Protein–RNA interactions for Protein: Q06265

EXOSC9, Exosome complex component RRP45, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC9Q06265 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 MIS18BP1-212ENST00000627697 1950 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EXOSC9Q06265 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
EXOSC9Q06265 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms