Protein–RNA interactions for Protein: Q05655

PRKCD, Protein kinase C delta type, humanhuman

Predictions only

Length 676 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKCDQ05655 IMPA2-208ENST00000589238 923 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 HOXA11-AS-205ENST00000522863 1723 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MAFB-201ENST00000373313 3393 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CD40-202ENST00000372285 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 FAM111A-204ENST00000528737 6189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 RAB22A-201ENST00000244040 8670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 HSDL1-202ENST00000434463 1493 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 POLR3D-201ENST00000306433 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PRKCDQ05655 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms