Protein–RNA interactions for Protein: Q04446

GBE1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, humanhuman

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBE1Q04446 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 AC127526.4-201ENST00000527970 983 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBE1Q04446 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 IGLL1-201ENST00000249053 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SAMD3-202ENST00000368134 2377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 FOXD4L1-201ENST00000306507 2491 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
GBE1Q04446 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms