Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AL353801.3-201ENST00000609898 542 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
GCNT1Q02742 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 GSTM4-201ENST00000326729 1321 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 NOMO1-201ENST00000287667 4355 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
GCNT1Q02742 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms