Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC027682.6-202ENST00000621378 795 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PROK2-202ENST00000353065 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 NLGN2-204ENST00000575301 4374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
DSC2Q02487 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms