Protein–RNA interactions for Protein: Q02413

DSG1, Desmoglein-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,049 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSG1Q02413 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 TRIB3-202ENST00000422053 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PPM1G-201ENST00000344034 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AAED1-201ENST00000375234 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 LTBP1-203ENST00000404816 6333 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 RBSN-204ENST00000449050 903 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC234772.2-201ENST00000456532 375 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AP005117.1-201ENST00000584346 1413 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 MEN1-201ENST00000312049 2761 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
DSG1Q02413 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 ANKMY2-206ENST00000628652 1270 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 FLT3LG-204ENST00000595510 1301 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PYCR2-208ENST00000612039 1549 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PYCR2-209ENST00000612651 1538 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC19.13■□□□□ 0.65
DSG1Q02413 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.5 ms