Protein–RNA interactions for Protein: Q02297

NRG1, Pro-neuregulin-1, membrane-bound isoform, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG1Q02297 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 CNIH3-201ENST00000272133 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 MFHAS1-201ENST00000276282 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 STRA8-201ENST00000275764 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 RPN2-201ENST00000237530 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
NRG1Q02297 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 NUDT10-202ENST00000376006 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 LINC01293-201ENST00000453951 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
NRG1Q02297 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms