Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 HMGN1-203ENST00000380748 829 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC097372.2-201ENST00000510996 732 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 ANO2-212ENST00000612575 1087 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 KRT81-201ENST00000327741 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 NDUFS7-210ENST00000539480 1743 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SMARCC2-203ENST00000394023 4271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 PSAP-205ENST00000610929 1969 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SPPL2C-201ENST00000329196 2238 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 FLYWCH1P1-201ENST00000460917 1874 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 VAV1-204ENST00000596764 2775 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CDC42EP1Q00587 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms