Protein–RNA interactions for Protein: P78412

IRX6, Iroquois-class homeodomain protein IRX-6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX6P78412 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
IRX6P78412 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX6P78412 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX6P78412 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX6P78412 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX6P78412 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX6P78412 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX6P78412 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
IRX6P78412 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX6P78412 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX6P78412 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX6P78412 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX6P78412 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX6P78412 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX6P78412 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
IRX6P78412 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 LCE2B-201ENST00000368780 612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
IRX6P78412 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
IRX6P78412 AC105285.1-202ENST00000499322 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
IRX6P78412 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms