Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 GNA14-201ENST00000341700 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 PSMD5-203ENST00000373904 1538 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 MSANTD1-203ENST00000507492 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 BID-215ENST00000622694 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 SRSF4-201ENST00000373795 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AL157392.3-207ENST00000601758 744 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AC004233.3-201ENST00000607794 1269 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 CAMK2B-216ENST00000440254 2097 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 IDH1-205ENST00000446179 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PIP4K2BP78356 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 ZNF606-202ENST00000546715 636 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 PLSCR3-212ENST00000576201 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PIP4K2BP78356 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.4 ms