Protein–RNA interactions for Protein: P63162

SNRPN, Small nuclear ribonucleoprotein-associated protein N, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPNP63162 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ADAM33-203ENST00000379861 3674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 HSD11B1L-223ENST00000616276 1580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNRPNP63162 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms