Protein–RNA interactions for Protein: P61574

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Rec protein, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P61574 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 RER1-204ENST00000378518 522 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SNRNP25-202ENST00000383018 1085 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 BET1L-204ENST00000410108 637 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AL355472.2-201ENST00000422958 438 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AC096631.2-201ENST00000436136 790 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 NEDD4L-237ENST00000617539 728 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CTSL-203ENST00000343150 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ZC3H4-201ENST00000253048 6119 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.64□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 MYH7-201ENST00000355349 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 DYNLRB1-203ENST00000374846 1044 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CAMLG-202ENST00000514518 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 TRIQK-221ENST00000524107 737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AC073896.1-201ENST00000549318 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 GOSR2-208ENST00000573224 1115 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SRRM2-231ENST00000630499 1207 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SYVN1-203ENST00000377190 3052 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 BST1-202ENST00000382346 1993 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.63□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.62□□□□□ -0.39
HERVK_113P61574 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.62□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.2 ms