Protein–RNA interactions for Protein: P55735

SEC13, Protein SEC13 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC13P55735 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC13P55735 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC13P55735 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC13P55735 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC13P55735 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC13P55735 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC13P55735 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC13P55735 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC13P55735 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
SEC13P55735 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC13P55735 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC13P55735 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC13P55735 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC13P55735 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC13P55735 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC13P55735 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
SEC13P55735 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 UNC93B6-202ENST00000528242 690 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
SEC13P55735 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 FGF14-IT1-202ENST00000607251 2123 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
SEC13P55735 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 TMEM8B-204ENST00000439587 2150 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
SEC13P55735 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms