Protein–RNA interactions for Protein: P53007

SLC25A1, Tricarboxylate transport protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 311 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC25A1P53007 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 FIGNL2-202ENST00000618634 4812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 SCARB2-201ENST00000264896 4792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SLC25A1P53007 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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