Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 SLC29A4P2-201ENST00000504749 1089 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 STEAP1B-201ENST00000404369 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERFP50548 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 OCIAD2-205ENST00000508632 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 FAM83A-205ENST00000522648 1604 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 AC120498.8-201ENST00000614275 531 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 PFKL-212ENST00000628044 129 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 SIN3B-206ENST00000595541 2767 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERFP50548 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 CLEC18C-201ENST00000314151 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 CLEC18A-208ENST00000568461 1934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERFP50548 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 ESPN-202ENST00000416731 1338 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 NUDT22-201ENST00000279206 1094 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 NUDT22-204ENST00000441250 986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERFP50548 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERFP50548 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERFP50548 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERFP50548 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERFP50548 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERFP50548 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERFP50548 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERFP50548 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERFP50548 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERFP50548 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ERFP50548 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.4 ms