Protein–RNA interactions for Protein: P50120

RBP2, Retinol-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 134 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBP2P50120 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TPSB2-203ENST00000612142 1352 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RBP2P50120 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TEX264-204ENST00000415259 2290 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
RBP2P50120 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.8 ms