Protein–RNA interactions for Protein: P49959

MRE11, Double-strand break repair protein MRE11, humanhuman

Predictions only

Length 708 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRE11P49959 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 AC026471.5-201ENST00000615068 467 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 SNX7-205ENST00000529992 1589 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 SERPINH1-201ENST00000358171 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
MRE11P49959 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 REXO2-201ENST00000265881 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 AUP1-201ENST00000377526 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 FAM207A-202ENST00000397826 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 ETV7-205ENST00000538992 1434 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 REXO2-208ENST00000539754 791 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 AP003071.4-201ENST00000562276 1284 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 WT1-211ENST00000639907 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 ZFP91-201ENST00000316059 5220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
MRE11P49959 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 APOLD1-202ENST00000356591 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 TRA2A-202ENST00000392502 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 GUCY1A2-202ENST00000347596 2532 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 POLR1D-203ENST00000399697 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 FNIP1-204ENST00000511848 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
MRE11P49959 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MRE11P49959 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
MRE11P49959 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms