Protein–RNA interactions for Protein: P49790

NUP153, Nuclear pore complex protein Nup153, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,475 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP153P49790 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
NUP153P49790 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 ANP32E-201ENST00000369114 1048 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 RNASEH1-AS1-202ENST00000438436 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
NUP153P49790 IL10RB-201ENST00000290200 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 BLOC1S1-201ENST00000547076 837 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
NUP153P49790 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
NUP153P49790 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 ZIC4-214ENST00000491672 925 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 LRRC23-215ENST00000622489 1061 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC27.57■■■□□ 2
NUP153P49790 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
NUP153P49790 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms