Protein–RNA interactions for Protein: P49638

TTPA, Alpha-tocopherol transfer protein, humanhuman

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAP49638 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
TTPAP49638 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 NOL7-202ENST00000451315 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 DDX31-201ENST00000310532 2408 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
TTPAP49638 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SPDYE5-203ENST00000625065 1700 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 REPS1-202ENST00000367663 2607 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 FRS3-201ENST00000259748 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
TTPAP49638 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
TTPAP49638 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
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