Protein–RNA interactions for Protein: P49411

TUFM, Elongation factor Tu, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 452 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUFMP49411 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AL356309.3-201ENST00000624132 1934 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 NSUN5-201ENST00000252594 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 PDLIM3-212ENST00000620787 2352 ntTSL 4 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 VKORC1-201ENST00000300851 876 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 ROMO1-203ENST00000374077 422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 SLC39A4-201ENST00000276833 2297 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TUFMP49411 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 MACF1-233ENST00000602421 1423 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC18.75■□□□□ 0.59
TUFMP49411 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 TNXA-203ENST00000507684 2038 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 ADPGK-201ENST00000311669 2557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 IL4I1-201ENST00000341114 2349 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TUFMP49411 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUFMP49411 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUFMP49411 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TUFMP49411 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms