Protein–RNA interactions for Protein: P48739

PITPNB, Phosphatidylinositol transfer protein beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 271 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITPNBP48739 NSD3-201ENST00000316985 3995 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 KRT8P41-201ENST00000533985 1514 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 HPF1-201ENST00000393381 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC108025.1-201ENST00000453678 1058 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AC008771.1-201ENST00000508000 1151 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AL731569.1-201ENST00000428940 3058 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
PITPNBP48739 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SPAG16-207ENST00000432529 1250 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FBXO32-202ENST00000443022 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CBLN1-202ENST00000536749 718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 GNAI2-204ENST00000440628 1663 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PITPNBP48739 STOX1-201ENST00000298596 3377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms