Protein–RNA interactions for Protein: P48426

PIP4K2A, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2AP48426 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PLEKHH3-204ENST00000591022 2983 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CCDC7-203ENST00000362006 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SPART-209ENST00000494062 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 EEF1D-238ENST00000531621 840 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PSMA6-216ENST00000627895 484 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 RBFOX1-222ENST00000585867 1580 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 MCU-201ENST00000357157 2874 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 P2RY6-212ENST00000618468 2431 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AP001058.1-201ENST00000423967 463 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 FAU-209ENST00000531743 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CCZ1-207ENST00000628813 2218 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 QKI-201ENST00000275262 6964 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 GTF2H4-202ENST00000376316 1673 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 LSM11-201ENST00000286307 6584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SUDS3-204ENST00000543473 4897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ACVRL1-202ENST00000419526 1356 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 AC008105.3-202ENST00000585471 1077 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
PIP4K2AP48426 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms