Protein–RNA interactions for Protein: P46939

UTRN, Utrophin, humanhuman

Predictions only

Length 3,433 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTRNP46939 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
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UTRNP46939 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 RIIAD1-201ENST00000326413 1772 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 AC007216.4-201ENST00000574364 562 ntTSL 4 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 LBHD1-201ENST00000354588 1320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
UTRNP46939 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 PCID2-202ENST00000337344 1898 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 HDAC1-201ENST00000373548 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 NDUFA4L2-202ENST00000554503 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
UTRNP46939 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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UTRNP46939 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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UTRNP46939 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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UTRNP46939 TRPV6-209ENST00000638686 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTRNP46939 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
UTRNP46939 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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UTRNP46939 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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UTRNP46939 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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UTRNP46939 AR-204ENST00000504326 3615 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
UTRNP46939 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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UTRNP46939 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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UTRNP46939 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
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UTRNP46939 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTRNP46939 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
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UTRNP46939 PVRIG-201ENST00000317271 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTRNP46939 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTRNP46939 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTRNP46939 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ZNF12-201ENST00000342651 2921 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
UTRNP46939 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 NRG2-204ENST00000358522 2559 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
UTRNP46939 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
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