Protein–RNA interactions for Protein: P43146

DCC, Netrin receptor DCC, humanhuman

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCCP43146 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCCP43146 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCCP43146 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCCP43146 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCCP43146 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCCP43146 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCCP43146 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCCP43146 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
DCCP43146 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCCP43146 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCCP43146 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCCP43146 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCCP43146 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
DCCP43146 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
DCCP43146 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
DCCP43146 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 CCT5-205ENST00000506600 1939 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 SNX1-213ENST00000561026 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
DCCP43146 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 WDR45-240ENST00000635003 1376 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC099522.2-201ENST00000607001 744 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC016065.1-201ENST00000500118 2413 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 MLST8-202ENST00000382450 1861 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 MLST8-215ENST00000564088 1861 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 SHB-201ENST00000377707 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
DCCP43146 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.2 ms