Protein–RNA interactions for Protein: P43119

PTGIR, Prostacyclin receptor, humanhuman

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGIRP43119 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 SLC22A18AS-203ENST00000625099 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGIRP43119 NCF1-201ENST00000289473 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 IFNAR2-204ENST00000382264 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 UBXN2A-201ENST00000309033 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 MFGE8-203ENST00000542878 1172 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 CCDC184-201ENST00000316554 2343 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 ZBTB46-203ENST00000395104 5198 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 TMEM59L-205ENST00000600490 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 ANKRD36-207ENST00000639293 1168 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
PTGIRP43119 CYP2D7-208ENST00000614967 1504 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms