Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 GPR62-201ENST00000322241 2191 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC129492.1-201ENST00000399413 1804 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
KDM5CP41229 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM5CP41229 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM5CP41229 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
KDM5CP41229 DISC1-215ENST00000602281 2761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5CP41229 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5CP41229 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5CP41229 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5CP41229 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5CP41229 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
KDM5CP41229 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms