Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ACHE-205ENST00000419336 1906 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 JKAMP-201ENST00000261247 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SSR4P1-202ENST00000429427 967 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FAM198A-202ENST00000430121 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AK3-202ENST00000381809 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AP002469.2-201ENST00000531724 424 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 RNF126P1-202ENST00000569893 925 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 TMEM177-204ENST00000424086 1738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
HOXC12P31275 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms