Protein–RNA interactions for Protein: P31268

HOXA7, Homeobox protein Hox-A7, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA7P31268 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 GTF2IRD2-207ENST00000625377 1910 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 KLF6-204ENST00000469435 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 ALDH5A1-201ENST00000348925 2266 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 KLK12-203ENST00000525263 1077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
HOXA7P31268 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms