Protein–RNA interactions for Protein: P30536

TSPO, Translocator protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPOP30536 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 PEX26-203ENST00000428061 815 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AL355355.2-201ENST00000442321 338 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AC116562.2-201ENST00000507042 360 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
TSPOP30536 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 MFAP1P1-201ENST00000442257 1255 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AL445645.1-201ENST00000451318 1019 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 DBNL-214ENST00000456905 1241 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 C14orf180-201ENST00000331952 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC13.79□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 ELFN2-208ENST00000430883 1970 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 A4GALT-201ENST00000249005 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 POMC-202ENST00000380794 1295 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 POLR2D-202ENST00000409698 806 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
TSPOP30536 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms