Protein–RNA interactions for Protein: P28340

POLD1, DNA polymerase delta catalytic subunit, humanhuman

Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLD1P28340 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 FSTL3-202ENST00000588773 746 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 ACD-214ENST00000620338 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 MMP28-201ENST00000605424 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
POLD1P28340 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 FAM66B-202ENST00000606573 2630 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 PQLC2-201ENST00000375153 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 OR8S1-201ENST00000310194 1080 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 Z98749.2-201ENST00000428294 700 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
POLD1P28340 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 PLD4-204ENST00000540372 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 NR6A1-202ENST00000373584 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 CYP27A1-201ENST00000258415 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 TRMT44-205ENST00000513449 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC073130.3-201ENST00000624389 2278 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 CHST1-201ENST00000308064 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
POLD1P28340 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 TSEN34-202ENST00000396383 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
POLD1P28340 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.9 ms