Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FIGNL2-201ENST00000564840 4693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 LENG8-AS1-201ENST00000416022 582 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 GNAS-AS1-203ENST00000598163 548 ntTSL 4 BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PANX1-202ENST00000436171 2750 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PLCH2-205ENST00000449969 5450 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC104971.2-201ENST00000588144 1209 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PSMB5P28074 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms