Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AL162430.1-201ENST00000480705 870 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 C14orf28-204ENST00000557112 1097 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TNNI3-207ENST00000588882 669 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 KLF2-202ENST00000592003 564 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SOX15-201ENST00000250055 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ACTR3B-203ENST00000397282 1692 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ANKRD39-201ENST00000393537 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 EMC6-202ENST00000397133 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AL645608.9-201ENST00000442292 829 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 Z85996.1-201ENST00000494644 937 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CIRBP-215ENST00000588030 1509 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 MED17-201ENST00000251871 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ANXA2-201ENST00000332680 1444 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
HLA-DMAP28067 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms