Protein–RNA interactions for Protein: P23763

VAMP1, Vesicle-associated membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAMP1P23763 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 RBPJ-205ENST00000355476 5990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 MED10-201ENST00000255764 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC068473.1-201ENST00000317008 1111 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ZPBP-203ENST00000419417 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC060766.5-201ENST00000590539 871 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC008687.6-201ENST00000596318 630 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC092118.2-201ENST00000613495 667 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AL161421.1-201ENST00000619666 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GUCA1A-201ENST00000053469 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ZNF302-215ENST00000627982 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 MRTO4-201ENST00000330263 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
VAMP1P23763 GORASP1-220ENST00000479927 1345 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms