Protein–RNA interactions for Protein: P23434

GCSH, Glycine cleavage system H protein, mitochondrial, humanhuman

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCSHP23434 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 FSCN2-202ENST00000417245 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
GCSHP23434 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 NDUFV3-202ENST00000354250 1575 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MTFP1-201ENST00000266263 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 INTS12-206ENST00000451321 1975 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 COPS9-201ENST00000307266 759 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 IFI6-202ENST00000361157 841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TCEAL6-202ENST00000372774 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AL357874.1-201ENST00000428948 574 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AP001458.2-201ENST00000528405 577 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 LINC00654-202ENST00000589201 579 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 NCBP2-AS2-201ENST00000602845 918 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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GCSHP23434 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
GCSHP23434 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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GCSHP23434 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GCSHP23434 DDAH1-205ENST00000539042 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GCSHP23434 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
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GCSHP23434 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 NUBP2-206ENST00000565134 815 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 NAT14-204ENST00000591590 1011 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PTCRA-204ENST00000616441 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
GCSHP23434 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
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