Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 PSTPIP1-201ENST00000379595 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 HOXC6-202ENST00000394331 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 MAPKAPK2-202ENST00000367103 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 GPAT2P1-202ENST00000471661 1569 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 HIST1H2AI-201ENST00000358739 503 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 LINC01785-201ENST00000598042 1112 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 PTGER3-202ENST00000351052 1404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 KIF25-AS1-201ENST00000414364 1420 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 MYOG-201ENST00000241651 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 OGFOD2-211ENST00000538628 1696 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
CCL3L1P16619 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.3 ms