Protein–RNA interactions for Protein: P09923

ALPI, Intestinal-type alkaline phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALPIP09923 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 AC112698.1-201ENST00000510299 916 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
ALPIP09923 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPIP09923 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPIP09923 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPIP09923 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPIP09923 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPIP09923 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPIP09923 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPIP09923 KLHL33-202ENST00000636854 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPIP09923 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPIP09923 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPIP09923 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
ALPIP09923 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 PLEKHG5-212ENST00000537245 4794 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 AP000867.3-201ENST00000524675 377 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 DLGAP1-222ENST00000639615 1898 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
ALPIP09923 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 ZNF131-206ENST00000505606 3209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 SPIN2B-202ENST00000333933 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 MARVELD3-202ENST00000299952 2214 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ALPIP09923 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPIP09923 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPIP09923 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ALPIP09923 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.9 ms