Protein–RNA interactions for Protein: P08100

RHO, Rhodopsin, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHOP08100 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 MARK1-203ENST00000402574 5273 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
RHOP08100 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 CRCP-205ENST00000431089 942 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 PCBP3-206ENST00000400314 2202 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
RHOP08100 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 AC073621.1-201ENST00000392730 636 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 KLHL23-201ENST00000272797 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 GPR162-201ENST00000311268 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
RHOP08100 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 TSR1-201ENST00000301364 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 SZT2-202ENST00000372450 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 AC004801.5-202ENST00000546804 530 ntTSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
RHOP08100 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.4 ms