Protein–RNA interactions for Protein: P06756

ITGAV, Integrin alpha-V, humanhuman

Predictions only

Length 1,048 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAVP06756 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ZIC4-212ENST00000484399 1774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 MAP4K4-204ENST00000350198 7316 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 MEAF6-205ENST00000448519 666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AC055811.2-201ENST00000427497 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 MSANTD1-201ENST00000438480 2922 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FAM110A-202ENST00000304189 1856 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AL162258.2-202ENST00000469931 831 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
ITGAVP06756 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.8 ms