Protein–RNA interactions for Protein: O95819

MAP4K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,239 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP4K4O95819 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 CCDC88C-203ENST00000389856 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 LEF1-AS1-201ENST00000436413 1045 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 TRAF7-205ENST00000567653 666 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
MAP4K4O95819 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 MCCC1-215ENST00000629669 2316 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 JMJD7-201ENST00000397299 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 AC012313.10-201ENST00000623509 926 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 SLC22A1-203ENST00000457470 1452 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 MAGEA3-201ENST00000370278 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 FOLH1-204ENST00000356696 2403 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
MAP4K4O95819 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms