Protein–RNA interactions for Protein: O75648

TRMU, Mitochondrial tRNA-specific 2-thiouridylase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMUO75648 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRMUO75648 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRMUO75648 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRMUO75648 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRMUO75648 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRMUO75648 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRMUO75648 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRMUO75648 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRMUO75648 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRMUO75648 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 EVPL-202ENST00000586740 6223 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 UBE2SP1-201ENST00000450587 669 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ROPN1L-202ENST00000503804 1291 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 DLEU7-203ENST00000504404 1122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRMUO75648 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 PCCB-216ENST00000483687 1727 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ENC1-207ENST00000618628 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 FAM197Y1-201ENST00000421178 764 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ZCCHC23-201ENST00000500526 1951 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRMUO75648 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRMUO75648 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TRMUO75648 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms